草薙素子が去って2年後の公安9課を描く。トグサが率いることになった組織に難事件が発生。捜査の結果、「傀儡廻」と呼ばれる超ウィザード級ハッカーの仕業だと判明する。
西暦2034年。公安9課から草薙素子が去り、2年の歳月が経過していた。トグサが新しく組織を率いる立場となり、メンバーも大幅に増員されて拡大を果たした新生公安9課に、次々と難事件が襲いかかる。捜査の結果、一連の事件を背後で操っている存在が「傀儡廻（くぐつまわし）」と呼ばれる超ウィザード級ハッカーであることが判明する。そんな中、別ルートで事件の追跡をしていたバトーは、偶然にも草薙に再会するが……。出演
| 役名 | 声 |
|---|---|
| 草薙素子 | 田中敦子 |
| 荒巻大輔 | 阪脩 |
| バトー | 大塚明夫 |
| トグサ | 山寺宏一 |
| イシカワ | 仲野裕 |
| サイトー | 大川透 |
| パズ | 小野塚貴志 |
| ボーマ | 山口太郎 |
| タチコマ | 玉川紗己子 |
スタッフ
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原作士郎正宗
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監督神山健治
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脚本神山健治
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脚本菅正太郎
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脚本櫻井圭記
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キャラクターデザイン後藤隆幸
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キャラクターデザイン西尾鉄也
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音楽菅野よう子
